Научная статья
Иммуногенетический профиль (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1) популяции русских Челябинской области
Ре зюме. Проведено иммуногенетическое типирование 591 донора ГБУЗ Челябинская областная станция переливания крови, идентифицирующих себя русскими, по 5 генам HLA-А, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1 на базовом разрешении. Был использован метод полимеразной цепной реакции с сиквенс-специфическими праймерами (SSP-PCR) со стандартными наборами (“Protrans”, Германия). С помощью стандартной иммуногенетической программы Арлекин рассчитаны частоты генов (GF), частоты двухи пятилокусных гаплотипов HLA (HF), величины неравновесного сцепления (D’) двухлокусных гаплотипов. Показаны наиболее характерные для русских Челябинской области аллельные семейства генов (А*01,*02,*03; В*07, В*44, В*35; С*03,*04,*07,*12; DRB1*01, DRB1*15, DRB1*13, DRB1*07; DQB1*02,*03,*05,*06) и гаплотипов A*01-B*08-C*07-DRB1*03-DQB1*02 (HF 4,06), A*03-B*07-C*07-DRB1*15-DQB1*06 (HF 3,3), A*03-B*35-C*04-DRB1*01-DQB1*05 (HF 2,88), A*02-B*13-C*06-DRB1*07-DQB1*02 (HF 1,61). Показаны наиболее сцепленные двухлокусные гаплотипы аллельных семейств генов В*-С* и DRB1*-DRQ1*. На основе расчета генетических расстояний (по Нею) по локусам HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, с использованием многомерного шкалирования, представлено расположение 56 популяций, включая данные по популяциям Челябинской области. Полученные закономерности могут быть использованы в практической работе для создания регистра доноров стволовых клеток России. Данные могут быть использованы как контрольная группа для проведения работ «ассоциация HLA с заболеваниями», использованы специалистами по этногенезу народов.
Summar y. Immunogenetic typing of 591 donors by 5 genes (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLADQB1) was carried out at the basic resolution. The donors identified themselves as Russians, blood specimens were collected at Chelyabinsk Blood Transfusion Center. The study was carried out by SSP-PCR with standard Protrans kits (Germany). The gene frequencies (GF), haplotypes frequencies (HF) for twoand five-lucus haplotypes, and linkage disequilibrium values (D’) for two-locus haplotypes were estimated using the Harlequin standard immunogenetic software. The study detected the gene allele families (A*01, *02, *03; B*07, B*44, B*35; C*03, *04, *07, *12; DRB1*01, DRB1*15, DRB1*13, DRB1*07; DQB1*02, *03, *05, *06) and haplotypes A*01-B*08C*07-DRB1*04-DQB1*02 (HF 4.06), A*03-B*07-C*07-DRB1*15-DQB1*06 (HF 3.3), A*03-B*35-C*04DRB1*01DQB1*05 (HF 2.88), A*02-B*13-C*06-DRB1*07-DQB1*02 (HF 1.61), most characteristic of the Russians in the Chelyabinsk region. The most strong-linked two-locus haplotypes of gene allele families B*-C* and DRB1*DRQ1* were presented. The location of 56 populations, including the data for the Chelyabinsk region populations, was presented on the base of estimation of the genetic distances (after Nei) by locuses HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 using multidimensional scaling. The resultant regularities can be used for creating a register of stem cell donors of Russia. The data can serve as the reference group for evaluation of HLA associations with diseases and be useful for specialists in ethnogenesis.
Идентификатор объекта в Сети | |
Создан | 1 января 2015 г. |
Объект зарегистрирован в Сети РЦИС.РФ | 8 октября 2019 г. |
Участники создания | Соавтор — СУСЛОВА ТАТЬЯНА АЛЕКСАНДРОВНА Соавтор — ВАВИЛОВ М.Н. Соавтор — СТАШКЕВИЧ Д.С. Соавтор — БЕЛЯЕВА С.В. Соавтор — ХРОМОВА Е.Б. Соавтор — ЕВДОКИМОВ А.В. Соавтор — ГОРЕЛОВА А.К. Соавтор — БУРМИСТРОВА А.Л. |
Код создания | Создан ранее, в том числе при регистрации наследником |
Тип | Научная статья |
Режимы правовой охраны |
|
Дополнительные атрибуты | collection: Киберленинка lang: rus publisher: ОАО «Издательство «Медицина» source: Гематология и трансфузиология |
Доступность | Допустимо свободное использование со ссылкой на автора (Территория: Весь мир); Дата начала: 01.01.2015; CC BY (Открытая лицензия, возможно использование с указанием авторства) (Территория: Весь мир); Дата начала: 01.01.2015; |
Реестр транзакций
Дата и время ↓ | Идентификатор | Инициатор ↓ | Транзакция ↓ | |
---|---|---|---|---|
08.10.2019, 20:47:03 | ada0ee87680ce1471865a694ed4a2b1d20a1b1a604ab45a6c341e9a1e2903a08 | user-webpublishers | A | |
08.10.2019, 20:46:54 | 2a986da40dd1968efa68c34ef9007395d943817b37633160da110743c4ac0594 | user-webpublishers | A | |
08.10.2019, 20:46:48 | 32489109172188dcff0ffa427d6d7da5da032e5b053fa74e09ba4bfa440e145e | user-webpublishers | C |